सीसीटीवी समाचार के अनुसार, स्थानीय समयानुसार 3 जनवरी को, जापान के भूमि, बुनियादी ढांचे, परिवहन और पर्यटन मंत्रालय ने टोक्यो हानेडा हवाई अड्डे पर विमान की टक्कर से पहले हवाई अड्डे के हवाई यातायात नियंत्रण विभाग और जेएएल यात्री विमान और तटरक्षक विमान के बीच कॉल रिकॉर्ड जारी किए। रिकॉर्ड बताते हैं कि हवाई यातायात नियंत्रण विभाग ने उस समय JAL यात्री विमान को लैंडिंग की अनुमति जारी की थी।
दूसरी ओर, 2 तारीख को स्थानीय समयानुसार 17:45 बजे, हवाई यातायात नियंत्रण विभाग ने तटरक्षक विमान को सूचना दी,"कृपया जमीन पर स्थिति पकड़कर रनवे पर टैक्सी करें।" तटरक्षक बल के विमानों को अभी तक रनवे में प्रवेश की अनुमति नहीं दी गई है.
इसका मतलब यह है कि तटरक्षक बल का विमान बिना अनुमति के रनवे में घुस गया, जो दुर्घटना का मुख्य कारण था।
हालाँकि, जापान ब्रॉडकास्टिंग एसोसिएशन (एनएचके) के अनुसार,घायल तटरक्षक परिवहन विमान के कप्तान ने पहले कहा था कि उन्हें उड़ान भरने की अनुमति देने के स्पष्ट निर्देश मिले थे;जापान परिवहन सुरक्षा बोर्ड ने आज दुर्घटना की जांच शुरू की।
पिछली रिपोर्टों से पता चला था कि रनवे पर दूसरे विमान से टकराने के बाद जापान एयरलाइंस एयरबस ए350 में आग लग गई थी। पूरा धड़ पूरी तरह से जल गया, लेकिन सौभाग्य से, विमान में सवार सभी 367 चालक दल के सदस्यों और यात्रियों को सुरक्षित निकाल लिया गया।
जापान एयरलाइंस के यात्री विमान से जिस तटरक्षक विमान की टक्कर हुई, उसमें 6 लोग सवार थे.कैप्टन को छोड़कर, जो गंभीर रूप से घायल हो गया और बच गया, अन्य सभी पांच लोगों की मृत्यु हो गई।